Bioinformática

GEB48
por Portal PPGGB
Publicado: 19/09/2019 - 11:00
Última modificação: 01/08/2019 - 17:28
Carga horária: 60 horas
Créditos: 
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Objetivo:

1. Oferecer recurso para acesso ao universo virtual das ciências da vida e a novos métodos de estudo que levam a entender e descobrir as relações entre informações vindas de diferentes áreas de pesquisa como genética, bioquímica, enzimologia, evolução, etc.
2-Acessar  os bancos de dados de DNA e proteínas através da Internet e a utilizar softwares de análise
2- Comparar seqüências, estrutura e função  de genomas , transcriptomas, proteomas e metabolomas;
3-Usar as ferramentas computacionais e estatística para análise de seqüências
 

Ementa:

1- Fundamentos de computação e rede, fundamentos em estatística, bancos de dados biológicos
4- Análise de seqüências de ácidos nucléicos e proteínas ao nível de gene e do genoma
5- Análise de dados da expressão gênica de Micro-arrays
6. Estudos de proteômica, metabolômica, interatômica e biologia sistêmica
6- Alinhamento de seqüências e busca de domínios,  perfis e motivos em  seqüencias de proteínas
8- Busca em bancos de dados com BLAST e PSI-BLAST
9- Previsão de estrutura secundária, visualização de estruturas 3-D de ácidos nucléicos e proteínas. Acesso ao PDB.
10- Análise filogenética e evolução molecular,  construção e análises de árvores filogenéticas
12- Desenvolver workshops de treinamento em bioinformática e laboratórios de bioinformática
13- Estudos de casos aplicando ferramentas de bioinformática para enternder a resistência a drogas,  desenho de novas drogas e vacinas
 

Bibliografia:

LESK, A. Introdução à Bioinformática.  Artmed Editora. 2008
JAMBECK, P., GIBAS, C. Desenvolvendo a Bioinformática. Ed. Campus 2001
RASHID, H.H.,BUEHLER, L.K..Bioinformatics Basics: Applications in Biologicas Science and Medicine. Boca Raton: CRC Press, 2000.
BAXEVANIS, A. D., OUELLETTE, B. F. Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. New York. Wiley-Interscience, 1998.
SETUBAL, J.C. , SETUBAL, J.M. Introdutuction to computational Molecular Biology .BROOKS/COLE PUBLISHING COMPANY.2000
PEVZNER. P.A. Computational Molecular Biology, An algorithmic approach MIT Press. Cambridge, MA. 2000